刷花呗的手续费会根据交易金额和商家的费率来计算。

如果使用花呗进行消费，那么交易的手续费会按照交易金额的百分比来收取。

一般来说，每笔交易的手续费会在商家设置的费率下进行计算，具体的手续费率取决于商家的经营情况和花呗系统的评估结果。

通常情况下，标准的手续费率为0.6%\~1%\左右。

但如果在还款时进行还款刷单的话，会增加刷卡手续费用比例的情况出现，不同的具体情况下的手续费用是不同的。

不过每笔支付宝的手续费是按照花呗的金额和商户的情况进行计算扣款的手续费的。

综合情况分析刷花呗进行一万金额的交易可能会扣除一定数额的手续费，但具体金额需要根据具体情况计算得出。

如果需要了解更准确的金额，建议咨询支付宝客服或花呗客服了解具体的手续费情况。